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医院坚持科教兴院战略，大力提高科研教学水平。为南京中医药大学附属医院，山东中医药大学、安徽中医学院教学医院、上海中医药大学国际教育基地。至今共取得省级科技进步奖1项、苏州市级科技进步奖10项、国家专利3项。昆山市中医医院，http://www.kstcm.org.cn，我院自主研发自制药品达102种，剂型14种。
医院现占地面积8万平方米，建筑面积6.8万平方米，开放床位775张，设有28个临床科室和 9个医技科室。全院职工1200余名，其中高级职称151名，博士9名，硕士生导师8名，硕士108名，在读硕士79名，享受国务院特殊津贴者1名，江苏省名中医1名，昆山市中医医院昆山市级首席医师4名，学科带头人8名。年门诊人次170余万，出院病人达2.8万。医院拥有1.5T磁共振、64层螺旋CT、直线加速器、钼钯等大型医疗仪器设备。
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