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医院重视专科建设和新技术的应用，做精做强每一项技术，以点带面，扩大优势。保持对核心学科投入的同时加强发展新技术和专病专治，快速发展了微创腔镜外科、器官移植、骨髓移植、干细胞康复治疗技术、__医学、微笑列车治疗唇裂、海南省农垦总医院官网腰椎间盘突出症专科、肝炎专科、糖尿病专科、甲状腺专科、乳腺外科、头颈颌面专科、脂肪肝专科等。
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海南省农垦总医院是一家集医疗、急救、教学、科研、康复、预防、保健、体检健康管理为一体的大型综合性医院，为海南省首批高分通过评审的"三级甲等医院"，2004年7月医院全面通过ISO9001：2000国际质量管理体系认证，是海南省、海口市及各市县医保、新农合、城镇医保定点医院，是广西医科大学、海南医学院教学医院。
