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学校坚持 “德育为首、育人为本、教学为主 ”的办学思想，通过规范的班级常规量化考核制度，校风、班风、学风建设取得了显著的成效。学校为 “省文明单位 ”、 “市德育先进学校 ”、 “市安全文明校园 ”。
学校近年来不断引进先进的教育教学和管理经验。2007年4月与南京市第一中学签订了 “手拉手 ”互助协议，南京市第六十六中学官网双方在课程计划、教师培养、教学研究、学生评价、学科讲座及教育教学管理等方面建立了定期交流机制，并在 “手拉手 ”实验班的办学过程中进行了深入、广泛的合作。2007年12月与北京外国语大学签订协议，被确定为 “中国基础英语素质教育实验基地 ”，南京市第六十六中学▲双方共同致力于基础英语教学领域的科学研究，在推动英语教师教学能力和学生英语学习能力的有效提升方面取得了丰硕的成果。
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南京市第六十六中学始建于1958年，现为江苏省三星级（省重点）公办中学。现有32个班级，在校生1500多名，教职工160余人，其中有高级教师58人，全国优秀教师、省劳动模范、市区学科带头人、市区优秀青年教师等先进80余人，硕士30余人。
