安徽省卫生厅官网，www.ahwst.gov.cn政府内设，办公室，人事处，规划财务处，政策法规处，卫生应急处理办公室(突发公共卫生事件应急指挥中心)，疾病预防控制局（省爱国卫生运动委员会办公室，省地方病防治领导小组办公室），农村卫生管理处，妇幼保健与社区卫生处，医政与医疗服务监管处，食品安全综合协调与卫生监督处，药物政策与基本药物制度处，科技教育处，省中医药管理局，外事处，保健处，离退休工作处，机关党委，省纪委(监察厅)派驻省卫生厅纪检组(监察室)
安徽省卫生厅是主管卫生工作的省人民政府组成部门，根据《中共中央办公厅，国务院办公厅关于印发的通知》（厅字〔2009〕3号）批准设置“安徽省卫生厅首页”www.ahwst.gov.cn。
按照安徽省政府办公厅《关于印发安徽省卫生厅主要职责内设机构和人员编制规定的通知》（皖政办〔2009〕99号）规定，省卫生厅机关行政编制为86名。其中，厅长1名，副厅长4名，纪检组长1名，省中医药管理局局长1名(高配副厅级)，处级领导职数27名
