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医院现有普外科、产科、儿科、心内科、肾内科、骨科等6个院级重点学科，多个院级特色专业，尤其以矫形外科、微创外科、贵阳医学院第三附属医院，http://www.sfy-gmc.com，不孕专科为代表的学科在省内外有一定的影响，医院于省内较早开展的同种异体肾移植术，手术成功的患者存活时间长达20年。近年来，医院开展的超声乳化人工晶体植入术，颅内、肝、肺、食道、胃肠、宫颈、卵巢、子宫内膜、贵阳医学院第三附属医院乳腺等肿瘤根治术及综合治疗，断指再植手术，微创人工关节置换，微创脊柱前后路手术，脊柱侧弯畸形矫正、人工颈腰椎间盘置换，肢体延长，骨不连接诊治，骨创伤微创手术，肩、肘、髋、膝及踝关节镜手术，小儿麻痹矫形手术，以及经皮穿刺房间隔缺损封堵术和冠状动脉支架植入术、冠状动脉搭桥术和心脏起搏器植入术、经股动脉栓塞术、ERCP等泌尿外科等在全省处于领先或先进水平。医院遵循“以病人为中心”的宗旨，广泛开展微创手术，开展的腹腔镜下肝胆、胃、疝气、阑尾、甲状腺手术，妇科腹腔镜和宫腔镜微创手术、贵阳医学院第三附属医院，http://www.sfy-gmc.com，脑外科微创手术、骨创伤微创手术等多项高难度手术项目和疑难病诊治项目获得了广泛好评和良好的社会效益。
贵阳医学院第三附属医院是国际紧急救援定点医院、国家级“爱婴医院”，是贵阳医学院、贵阳中医学院、遵义医学院和黔南州医学高等专科学校的教学医院，是黔南州传染病定点收治医院，是黔南州和都匀市医保定点医疗机构，是省内医保患者转诊定点医院，承担着黔南州400多万人民群众的医疗保健工作，服务范围辐射全州12个县市以及临近的广西、广东及湖南等周边省区。
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