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伊犁州中医院紧紧围绕 “承中医文化、融西医精髓、创一流名院 ”的发展目标，以提高医疗技术水平和服务质量为出发点，加强专科专病建设。已建成专科11个，重点、特色科室有眼科、中西哈医骨伤科、肛肠科、肾病科、伊犁州中医院官网风湿免疫科、针灸__科，显微手外科、男性科，其中眼科为国家中医药管理局 “十一五 ”重点专科建设项目及伊犁州重点专科，针灸科为自治区中医药管理局首批中医民族医药重点学科建设项目单位，肛肠科为州重点专科并设为伊犁州肛肠中心。
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“不到新疆不知中国之大，还到伊犁不知新疆之美 ”。伊犁哈萨克自治州地处亚欧大陆腹地，自然风光壮观秀丽，是世界著名的东方小夜曲《草原之夜》的诞生地，素有 “中亚湿岛 ”和 “塞外江南 ”的美称。
