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代表现代新兴产业的动漫服务外包产业也快速起步，搜三百网络科技、宇生动漫、明光数码科技、蓝天动漫、柏盛动漫等一批极具发展潜力的企业已入区发展。
新材料、机械电子产业也快速起步，已表现出了科技含量高、投资规模大、菏泽高新技术产业开发区，http://www.hzgxq.gov.cn，发展后劲足的特点。山东中厦电子有限公司拥有10多项国际领先专利技术，开发了19种高科技产品，申请发明专利7项，获省市级创新基金2项，其中敏感智能新材料被列入国家 “863计划 ”；菏泽宏瑞新型材料有限公司的氧化锆陶瓷纤维及增强的磷酸盐基宽带透波复合材料被国家列为 “863 ”计划新型材料领域的研究课题，填补了国内空白；山东良艺公司研发的 “STC水溶性树脂 ”被科技部列为国家级新产品，获山东省科技进步奖；山东华盛荣镁业科技公司拥有22项以上国家专利技术和产品，1项国际专利产品，其中 “镁合金宽幅型材挤压装置及生产工艺 ”是国家重点支持的新材料制备创新项目，填补了世界空白，被列入2010年山东省自主创新成果转化重大专项，并进入国家 “十二五 ”科技发展规划，菏泽高新技术产业开发区投产后年产值可达200亿元；菏泽广源铜带股份有限公司研发的压延性电子铜箔厚度仅为0.006毫米，技术水平国际领先，填补国内空白，已申报国家科技支撑计划，进入了国家 “十二五 ”科技创新规划，开发的 “耐腐蚀高精黄铜带项目 ”和 “移动通讯RF同轴电缆专用高精高导铜带 ”项目分别被列入省、市重大科技专项。
截止目前，园区累计引进项目过110个，投资总额150多亿元，其中高新技术项目56个；投产企业达到81家，市级以上高新技术企业达到13家，其中国家级1家、省级7家；建有省级企业技术中心3个、市级8个；全市科技创新企业3家、创新试点企业9家；拥有中国驰名商标4个、省级著名商标16个，3家企业产品获 “中国名牌 ”称号；有2家企业跃居中国制药工业百强，6家企业被列入全市60强，1家企业入围全省纳税先进企业百强，2家企业跻身全市纳税前10名，6家企业进入全市纳税60强。医药加工、新材料、机械电子、食品加工四大主导产业特色突出，形成了以步长制药、菏泽高新技术产业开发区，http://www.hzgxq.gov.cn，睿鹰先锋制药、健民药业、华信制药等为主的医药加工，以华盛荣镁合金、广源铜带、宏瑞超高温耐火材料等为主的新材料，以海普电器、中厦电子、华龙电子等为主的机械电子，以兔巴哥食品、米老头食品、巧媳妇食品等为主的食品加工四大产业集群。预计今年园区实现产值110亿元、利税28.7亿元、上缴税金8亿元。其中，高新技术产业产值可突破90亿元，占园区总产值的80%以上。高新区建设呈现出了科技创新能力逐步增强、菏泽高新技术产业开发区；主导产业继续聚集壮大、经济总量快速膨胀的良好发展态势。
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