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学校长期致力于新教育思想的构建，不断总结反思在示范校建设和后示范校发展这几年的做法和经验，不断强化科学管理，已形成教育思想新，教研气氛浓，教学质量高的办学格局，全面推进素质教育已初见成效。在党的十七大精神为指引下，运河中学以实施 “北京新城区 ”教育发展战略和打造 “新兴的教育强区 ”为动力，运河中学，http://www.yunhe.net，以办好人民满意的教育为目标，以凸显内涵发展，实现 “四个转变 ”为中心（即从相对传统的教学理念向新课程教学理念的转变；从一般意义的教师队伍建设向教师队伍专业发展转变；从初步办有特色向具有显著学校特色转变；从北京市示范高中校向北京市名校转变），以学校特色建设为重点，在校园文化建设，教师专业发展，校本课程研发，教育质量提升等诸方面力求取得新的突破。继续发挥 “北京市示范高中校 ”的示范和辐射作用，使运河中学成为引领和带动区域教育发展的一面旗帜。
在长期办学实践中，运河中学对自己的办学优势不断提炼、扩散和升华，形成具有相对稳定的、运河中学不可替代的风格和突出的、个性化的办学风貌。学校始终坚持 “以人为本 ”的管理思想，秉承 “一切为了学生发展 ”的办学宗旨，坚持 “依法治校，规范办学，追求卓越，争创一流 ”的办学指导思想，并以 “严谨、求实、勤奋、创新 ”为校训，形成了 “和谐发展教育 ”的办学特色。学校以校本教科研引领教师的专业化发展，鼓励教师成为研究型、学者型专家，建设学习型学校。运河中学 “十五 ”教科研硕果累累，成绩卓著，多项教育科研成果受到市区级表彰；学校实施层次目标管理，建立由学科教师组成的以年级学科教研组长为核心的学科教学中心和由班级任课教师组成的以班主任为核心的教育管理中心，形成了管理层次清晰、目标明确、效率高的 “低重心 ”管理体系；大力推进教育教学的改革，实施层次目标教学，在高中新课程背景下创新教育教学模式，运河中学，http://www.yunhe.net，促进各个层次的学生共同发展，使教育教学质量稳步提升并得到社会普遍认可。
学校占地面积73亩，建有办公楼、教学楼、实验楼、电教综合楼，学生宿舍楼、学生公寓和400米塑胶跑道运动场等基础设施。学校环境恬静典雅，教学设施完备，是北京市中小学德育工作先进集体、全国百所德育科研名校、北京市文明礼仪学校、北京市奥运教育示范校、北京市环境示范校、北京市电化教育优类校、绿化美化先进单位、首都文明单位。
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