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三明市卫生局的主要职责是贯彻国家爱国卫生工作的方针、政策和法规，拟订全市爱国卫生工作的地方性法规和有关规章制度，并组织实施。研究拟定全市爱国卫生事业发展规划和目标。组织、协调开展巩固国家卫生城、创建省级卫生城等活动。负责组织全市除 “四害 ”活动，制订除 “四害 ”规划，督促、检查年度目标落实，组织除 “四害 ”考核、评比验收，做好除害、消杀、灭药械的管理。组织实施全市农村改水、改厕规划，做好以改水改厕为重点的农村爱国卫生工作。组织协调县（市、区）有关部门和团体的爱国卫生工作，检查全市爱国卫生工作开展情况，进行卫生效果评价。开展爱国卫生宣传和健康教育活动。开展群众性卫生监督工作。
