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医院始终秉承 “仁心良术 ”的医院精神，倡导 “以人为本、精益求精、团结务实、创新图强 ”的院训，以一流的质量、一流的技术、一流的服务、一流的环境为人民的健康做出贡献。
医院神经病学是教育部高等学校重点学科；骨科学、耳鼻咽喉 mdash;头颈外科学是卫生部重点建设学科；内科学、外科学、吉林大学中日联谊医院官网眼科学、耳鼻咽喉科学、临床检验诊断学、影像医学与核医学是吉林省教育厅普通高等学校重点学科。医院中心研究室是国家中医药管理局分子生物学三级科研实验室，是吉林省高级人民法院、长春市中级人民法院亲子鉴定指定实验室。医院检验科是卫生部临床检验中心的临床基因扩增检验实验室。吉林省临床分子生物学重点实验室、吉林大学中日联谊医院▲吉林省心血管病重点实验室、吉林省消化系病重点实验室、吉林省创伤骨科重点实验室、吉林省整形外科重点实验室、吉林省耳鼻咽喉－头颈外科重点实验室、吉林省医学影像重点实验室设在医院。医院主办的《中国实验诊断学》杂志是中国科技核心期刊。
医院装备有核磁共振扫描仪（MRI）、64排螺旋CT、数字平板血管造影系统、全数字化电子直线加速器、三维数字化C形臂X光机、实时三维心脏超声影像系统、计算机放射成像系统（CR）、全自动生化分析仪、吉林大学中日联谊医院官网，流式细胞仪等先进诊疗设备千余台（套）。医院年门诊量70余万人次，年出院4.2万人次，年手术1.5万人次，患者平均住院日12.2天。
新医院是由吉林省人民政府和长春市人民政府拨地、卫生部投资基建、日本政府无偿援助价值26亿日元先进设备而共同兴建的，新医院的建成是中日两国人民、两国政府友谊的结晶，医院被命名为 “白求恩医科大学第三临床学院（中日联谊医院） ”。2000年6月，吉林大学、白求恩医科大学等5所高校合并组建新吉林大学，医院易名为 “吉林大学中日联谊医院 ”。
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吉林大学中日联谊医院，坐落于吉林省长春市经济技术开发区，是教育部直属高校 mdash; mdash;吉林大学所属的、卫生部部管的一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的全民所有制、非营利性、大型现代化综合性三级甲等医院。
