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厦门市环境监测中心站秉持 “科学、严谨、公正、高效 ”的质量方针，在 “三个代表 ”思想指引下，坚持科学发展观，努力建设与国际接轨，创国内一流，现代化监测站，做好本职工作，为厦门的海湾型生态城市建设贡献一份力量。
几年来，厦门市环境监测中心站官网在完成各类监测任务的同时，我站积极参与环保科技项目的研究和开发，其中包括参与了国家七五、八五环保重点科技攻关项目，员当湖综合整治等科研课题，曾获省市科技进步成果奖十多项，2003年又荣获省科技进步成果三等奖一项。目前我站是厦门大学海洋环境学院、化学与化工学院、厦门市环境监测中心站▲集美大学等大专院校的实习基地。
建站二十多年来，在上级环境保护主管部门和市各有关部门的关心支持下，仪器设备和测试能力逐年提高，现拥有实验场所3000m2，各种先进的仪器装备总值达3000多万元，配备包括环境空气自动监测系统、电感耦合等离子质谱仪、原子吸收、气质联机、离子色谱、气相色谱、定硫仪、流动注射分析仪和总有机碳等较为齐全的环境监测大型精密分析仪器。1998年成为全国第二个实现空气质量日报的重点城市，厦门市环境监测中心站官网，2001年又实现环境空气质量预报。1999年经国务院有关部门批准，正式代表我国参与东亚酸沉降监测网，并参与了中日韩三国污染物远距离输送等项目研究，成为环保国际合作交流的一个窗口。近两年来我站还从国外引进大气应急监测车、水质自动站、海洋监测浮标等设备，提高了应急监测和海洋环境监测的能力。在人才方面，我站拥有一批高学历、高水平的监测骨干队伍。中心站编制84名，大专以上学历超过 80 % ，其中博士1人、硕士８人；高中级以上职称35 人，高级工程师12人、工程师23 人。
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厦门市环境监测中心站原名为厦门市环境监测站，始建于1978年， 2003年，中国环境监测总站在我站设立中国环境监测总站台湾海峡近岸海域监测分站；2004年7月根据厦委编42号文精神，为了更好整合资源、发挥我市环境监测机构的功能，将同安环境监测站、市农业环境监测站并入厦门市环境监测中心站。
