菏泽市牡丹区卫生局，www.mdqwsj.gov.cn政府先后被授予全省卫生工作先进集体，全省卫生系统行风建设先进集体，全省艾滋病综合防治先进单位，全省学习型组织先进单位，全省医政管理先进单位，全省卫生监督先进单位，市级文明单位，全市安全生产先进单位，全市五一劳动奖状，牡丹区2007年度政风行风建设先进单位等多种荣誉称号
菏泽市牡丹区卫生局机关设4个职能股(室)，包括办公室，人事股，医政股，监控股，另有，新型农村合作医疗管理委员会办公室和红十字会办公室设在机关院内，主要担负着全区的医疗救治，疾病预防，卫生监督，妇幼保健等职能“菏泽市牡丹区卫生局”www.mdqwsj.gov.cn。
近年来，牡丹区卫生工作在各级党委，政府的正确领导和大力支持下，认真贯彻党的十七大精神，全面落实科学发展观，以建设基本医疗卫生制度为核心，以人人享有基本医疗卫生服务为目标，落实预防为主，以农村为重点，中西医并重的方针，加强公共卫生，农村卫生和社区卫生服务体系建设，完善以新农合为重点的医疗保障制度建设，深化医疗卫生体制改革，加强卫生人才队伍建设，加大卫生依法行政力度，积极构建和谐医患关系，努力缓解群众看病难，看病贵问题，促进了卫生事业又好又快发展
