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集团始终坚持科技兴院的方针，积极开展推广新技术、新项目，鼓励科技创新。五年来，承接国家级科研课题1项，省级科研课题2项，市级科研成果12项，获得国家级科研成果1项，市级科研成果3项，在省级以上刊物发表论文134篇，芜湖市第三医疗集团官网主编专著1部，主编参编教材21部。
集团全力打造具有鲜明中医特色的中医专科专病和专科医院。中医院现有一个国家重点中医专科专病：高血压治疗中心；七个省级重点中医专科专病，五个市重点中医专科专病。弋江区医院的眼科被安徽省卫生厅确认为临床医学特色专业，是芜湖市重点扶持学科，并承担芜湖市贫困白内障患者复明民生工程任务，现正积极申报成立芜湖市眼科医院。市牙防所是我市唯一一所集牙病治疗与预防为一体的公立医疗卫生机构，芜湖市第三医疗集团▲现正筹办芜湖市口腔医院。
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2009年底，芜湖市作为全国医改试点城市，实行公立医院集团化改革，成立了三个医疗集团。市第三医疗集团以芜湖市中医医院为核心医院，其他成员单位有市牙防所、中医药高专二附院、弋江区医院、市中医院城北分院、中山南路、马塘、澛港、弋江桥、龙山、万春街道社区卫生服务中心以及东方医院、新安中医院两所民营医院。目前集团通过医疗资源整合，实行优势互补、资源共享、错位发展，做大做强特色优势，全力打造中医特色、眼科特色、口腔特色三大特色品牌。
