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出版社下设行政总编办公室、编辑部、船舶编辑室、出版科、发行科、教材供应中心、音像设计部和读者服务部八个部门。我社拥有专业门类基本齐全，梯次完整的编辑队伍，在编43人。有专职编辑24人，哈尔滨工程大学出版社官网其中高级职称7人，中级职称12人。具有本科学历者占全社人数的95%。20年过程中，在出版社改革方面的措施。根据不同的岗位，不同情况分别实行了岗位责任制、目标管理责任制和承包责任制,先后制定了 “出版社生产经营财务管理办法 ”和 “出版社改革方案 ”，以及一系列的生产经营和管理办法，哈尔滨工程大学出版社▲极大地调动了职工的积极性和创造性，使图书规模和数量大大增加，进一步扩大了出版社的积累，真正做到了以书养书、以社养社。并在有了一些盈余的情况下，出版社主动出资设立了 “教材专著出版基金 ”，以支持学校的教材建设和中青年教师优秀学术著作的出版。经过二十年的不懈努力，哈尔滨工程大学出版社培养了一支具有现代意识、肯于钻研、勤奋向上的编辑队伍，管理水平和经济实力已有较大程度的增强。目前每年推出新书120余种，哈尔滨工程大学出版社官网，修订再版100余种。哈尔滨工程大学出版社在选题策划上具有长远眼光，在新版图书大量涌现的同时， 再版率已接近50％，其中有的图书销量经久不衰，重印达10多次。有的图书已形成品牌效应，为出版社的进一步发展奠定了基础。自建 社以来，有近百种图书获得国家级和省部级等的奖励，受到社会各界和同行业的好评。
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哈尔滨工程大学出版社原名哈尔滨船舶工程学院出版社，成立于1985年2月。由哈尔滨工程大学主办，原由中华人民共和国国防科学技术工业委员会主管，现由中华人民共和国工业和信息化部主管。是国防科工委直属的大学出版社。
