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医院坚持 “以人为本 ”，从最广大职工利益出发。积极推进医院后勤化改革和劳动人事制度改革；医院重点加大对35岁以下优秀青年的培养力度和考核力度，将启动四期 “院优秀人才培养计划 ”；三期院级重点学科建设项目，重点支持有发展潜力的临床学科。
医院年门急诊病人193万人次，年出院病人4.1万人次，年施行住院手术1.4万例，门诊手术5.5万例。各学科临床水平不断提高，其中口腔颌面外科、整复外科和骨科在国内外诸多领域达国际领先水平，上海第九人民医院官网成为全国知名品牌。近年来， “裸鼠背上长人耳 ”、 “国内首例胸骨裂畸形 ”小吴菁修复术、 “中国第一毛孩 ”于震环外耳道整形术、 “下颌骨骨化性纤维瘤 ”欧阳莉菁肿瘤切除植骨修复术等曾轰动全国。
医院占地面积61亩。医院核定床位1000张，口腔综合椅位260张，临床科室33个，上海第九人民医院▲医技科室9个。全院职工2200余人，医疗专业技术人员占82%以上，其中副高职称以上专家350余人。现拥有3位中国工程院院士：著名整复外科专家张涤生、口腔颌面外科专家邱蔚六、骨科专家戴尅戎，以及国家973项目首席科学家曹谊林教授和上海市十大科技精英、上海市领军人才、卫生部突出贡献中青年专家张志愿教授。
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上海交通大学医学院附属第九人民医院的前身 “伯特利医院 ”创建于1920年。1952年更名为上海第九人民医院，1964年正式成为上海第二医科大学附属第九人民医院（以下简称 “九院 ”），2005年上海第二医科大学与上海交通大学正式合并，九院改名为上海交通大学医学院附属第九人民医院。
