重庆交通大学学校办学历史悠久。1951年11月，邓小平领导的西南军政委员会为建设大西南，创建了重庆交通大学的前身西南交通专科学校，时任西南军政委员会交通部部长，康藏公路筑路指挥部政委的穰明德任首任校长。1960年8月，成都工学院土木系，武汉水运工程学院水工系和四川冶金学院冶金系并入学校，组建重庆交通学院，同年，学校面向全国招收本科生。1985年，学校成为国家第三批硕士学位授予单位，开始招收硕士研究生。2000年，重庆其他交通类院校并入学校。2006年，学校新增为博士学位授予单位，并更名为重庆交通大学。2007年，学校接受教育部本科教学工作水平评估，结论为优秀。2009年，国家批准在我校设立土木工程一级学科博士后科研流动站重庆交通大学官网,网址,，www.cqjtu.edu.cn。
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