主题检索：在PubMed主页的检索框中键入英文单词或短语（大写或小写均可）， PubMed即使用其词汇自动转换功能进行检索，并将检索结果直接显示在主页下方。例如：键入“vitamin c common cold”后回车或点击“Go”，PubMed开始检索并将检索结果显示出来。
7. 免费个人化检索服务—My NCBI：在MY NCBI服务页建立个人检索帐号/密码后，即可使用个人化检索服务，该服务提供储存/删除检索结果、My LinkOut设定及文献传递等个人化服务
5. Clinical Queries: 临床病理资料，本功能提供临床病理资料之查询，并依Haynes RB等专家所制订的最佳化检索策略之机制，使用者可先行选择检索方向，PubMed生物医学信息检索系统官网如：治疗方式(Therapy)、诊断方式(Diagnosis)、病因(Etiology)、预后状况(Prognosis)其中的一类，并可选择预期之检索结果是较具相关性(sensitivity)或精确率(specificity)较高的。
3. Single Citation Matcher：使用栏位化的检索方式，找寻特定刊名、卷期、作者、篇名的文献资料。
1. Journal Database： 可透过输入期刊刊名、PubMed生物医学信息检索系统▲ISSN或Medline刊名缩写查询期刊的出版资讯。
Publisher-Supplied Citations （Articles Not in MEDLINE or IN Process）是由出版商提供的电子文献，每条记录标有。这些文献包括两种来源：MEDLINE收录范围的文献，每日被添加到In Process Citation中去，换上的标记，并赋予一个MEDLINE的数据识别号UI；不属于MEDLINE收录范围的文献则只有PubMed数据识别号PMID而没有MEDLINE UI。
In Process Citations 1996年8月开始，每天收录由MEDLINE的期刊出版商提供的尚未经过规范化处理的数据，该库中的记录只具有简单的书目信息和文摘、记录标记为。当该库中数据被标引MeSH词、文献类型及其他数据时，每星期转入MedLine一次，而被处理前的数据从该数据库中删除。
PubMed医学文献检索服务系统，其数据主要来源有：MEDLINE、PubMed生物医学信息检索系统官网，OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等。数据类型：期刊论文、综述、以及与其它数据库链接。
PubMed是因特网上使用最广泛的免费MEDLINE,是美国国家医学图书馆(NLM)所属的国家生物技术信息中心(NCBI)于2000年4月开发的,基于WEB的生物医学信息检索系统,它是NCBI Entrez整个数据库查询系统中的一个。PubMed界面提供与综合分子生物学数据库的链接，其内容包括：DNA与蛋白质序列，基因图数据，3D蛋白构象，人类孟德尔遗传在线，也包含着与提供期刊全文的出版商网址的链接等。
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