5个省部级重点实验室：即实验畸形学教育部重点实验室，心血管重构与功能研究教育部和卫生部重点实验室，耳鼻咽喉科学卫生部重点实验室，精神疾病基础与临床山东省重点实验室，感染免疫山东省重点实验室 ;1个山东省高校重点实验室：慢性退行性疾病的蛋白质科学重点实验室有临床医学和基础医学2个博士后科研流动站，基础医学、临床医学、生物学和生物医学工程学4个一级学科博士学位授权点，29个二级学科博士学位授权点。
医学院十分重视学科建设，现有3个国家级重点学科即人体解剖与组织胚胎学、内科学、妇产科学 ;13个省级重点学科：即人体解剖与组织胚胎学、免疫学、病原生物学、病理学与病理生理学、内科学、影像医学与核医学、外科学、妇产科学、耳鼻咽喉科学、遗传学、老年病学、神经病学、药理学。
山东大学医学院是我国最早建立的医学院校之一，为原山东医科大学的主体部分。其悠久的历史可追溯至1864年创办于登州的文会馆，1911年，共和医道学堂大讲堂在济南正式落成，成为今天山东大学医学院的历史源头。1952年由齐鲁大学医学院、山东省立医学院、华东白求恩医学院合并成立山东医学院 。1985年山东医学院更名为山东医科大学。
