三明市教科所(教研室)内设办公室、总务处、师干训研究室、高中教育研究室、初中教育研究室、职业教育研究室、小学(幼儿)教育研究室、体美音教育研究室、教育科学规划研究室、德育教育研究室、综合教育研究室、现代教育技术室等十二个科室;现有在职教职员工34人(核编40人)，其中高级职称22人，中级职称9人，(其中特级教师6人);拥有图书阅览室、微格教室、学术报告厅、多媒体功能厅和多媒体教室、网控中心，创建了局域网，编辑出版《三明教研》季刊，开通了“三明市教育科学研究所”网站。
三明市教育科学研究所、三明市普通教育研究室(前身为三明市教师进修学院，始创于1958年。1999年9月撤并、更名为三明市教育科学研究所、三明市普通教育研究室)，隶属于三明市教育局。承担着全市基础教育的教学研究、教学指导、教学质量监控、课程教材培训、教材建设和教科研课题管理等职能，是三明市教育学会、三明市基础教育科研管理领导小组办公室、三明市中小学心理健康教育指导中心的挂靠单位。单位占地面积7.8亩，建筑面积5000多平方米，地理位置处于三明市梅列区东安新村23幢。
