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医院始终秉承 “以科学精神体现人文关怀 ”的理念，坚持用最先进的诊疗方法、最优质的服务，为解除精神病人的痛苦而不懈地努力。上个世纪50年代，在氯丙嗪进入精神科治疗不到两年， “冬眠治疗 ”即率先在这里开展。70年代该院在极端困难的情况下开展了农村社区家庭精神疾病防治。改革开放以来，医院不断探索和引进各种先进的诊疗方法，不断改进服务设施和服务质量。北京大学第六医院官网住院医疗在病房设置上渐趋完备，设有普通病房、儿童病房、老年病房、特需医疗病房、以治疗酒依赖和各类神经症性障碍见长的临床心理病房以及完全开放的自愿住院病房。同时，在大兴区精神病院的农疗基地，还设有精神康复病房，北京大学第六医院▲为慢性精神障碍患者提供生活和劳动技能训练。住院医疗模式逐渐向半开放、开放转化，尽量缩短患者的住院时间，尽力使患者保持与社会的密切联系，以利于患者更好更快地回归社会。门诊除普通门诊、专业门诊、专家门诊和特需门诊外，还设有多专家会诊，负责讨论疑难病例的诊断和治疗。联络会诊科搭建了面向综合医院。
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北京大学精神卫生研究所（北京大学第六医院、北京大学精神卫生学院）是北京大学精神病学与精神卫生学的临床医疗、人才培训与科学研究基地，是世界卫生组织(WHO)在北京的精神卫生研究和培训协作中心，同时也是中国疾病预防控制中心的精神卫生中心。医院（所）是集临床医疗、人才培养、科学研究与公共卫生多项功能为一体的专业卫生机构，在精神病学与精神卫生领域里处于国际知名、国内领先的地位，是一所专科三级甲等医院。
