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黑龙江林业职业技术学院生态工程系于2001年组建，下设天然林保护技术、园林与花卉技术、绿色食品工程、生态工程、生物制药和中药栽培与利用等六个理科类专业。其中02年省政府批准天然林保护技术、园林与花卉技术为省级试点专业，学院投入了大量资金进行了基础设施、黑龙江林业职业技术学院，http://hljlzy.com，实验实训建设，比省内同行专业领先一步，达到了国内先进水平。生态工程系现有教师45人，具有副高职以上职称26人，教学名师3人，省森工院校学科带头人2人，具有硕士学位教师16人，有国家职业资格技能考评员4人，黑龙江省职业资格技能考评员3人，双师型教师18人。有3人到日本、德国参加专业与教学培训，黑龙江林业职业技术学院师资力量雄厚。近年来在省部级以上学术期刊上发表学术论文416篇，编写教材16部，取得技术专利两项，科研和教研成果18项。其中4项获得地市级科技进步奖，2项获得省级教学研究成果奖，编写教材8部。在教学中注重实践教学和学生技能的培养，加强实训条件建设，现有16个专业实验室，设施配套，性能良好，其中组织培养室、温室、大棚在承担教学任务的同时进行森林苗木和园林花卉的生产，每年创产值数万元；植物标本园栽培420多种木本植物，为黑龙江省第二大森林植物园，是黑龙江省重要木本植物种质资源基因库，是该系重要科研、教学的基地。该系还有夹皮沟林场等实训基地，青梅实验林场一处（4975公顷），实习苗圃一处（38亩），为实施产、学、黑龙江林业职业技术学院，http://hljlzy.com，研相结合的办学模式打下了坚实的基础。
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