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公司（中心）的发展战略定位为：建立和加强功能基因组和药物基因组研究、转化医学和生物芯片综合技术平台的竞争优势，通过自主经营和资本运作方式，整合技术、资本和人才资源，打造和发展科研与成果的应用转化、分子及健康诊断产品和药物研发的技术服务外包业务三大主营业务，采用“联合舰队”的经营方式，形成以芯片公司为旗舰，各控股子公司为专业舰，共同组成的联合舰队式的生物医药技术集团公司。
2003年2月，上海生物芯片官网国家发展与改革委员会批准上海生物芯片有限公司负责建设和运行“生物芯片上海国家工程研究中心”。生物芯片上海国家工程研究中心建设和发展的目的在于促进中国生物芯片技术的研究和产品开发，推动生物芯片及相关的技术和产业的发展，为行业提供技术平台的支持，培养生物芯片行业的人才，是国家创新体系的一部分，代表行业的发展方向，具有创造自主知识产权的能力，促进相关的产业化进程，上海生物芯片有限公司▲体现国家意志，承担国家重大重点的科技攻关任务。同时，它是独立运行的企业，必须建立起独立生存、自我发展、能够在市场上经历风浪抵抗风险的能力。在这个指导思想下制定公司（中心）的发展战略与规划。
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随着社会发展和科技的进步，人们对健康保健日益重视，而与健康相关的各种疾病中，大多数与人自身的遗传和生活状态有密切的关系。对于这类疾病，必须从遗传分子水平上加以检测，进而加以控制。生物芯片技术是综合了现代科学技术成果的高通量生物分子水平的检测系统。它不仅为生命科学研究和药物的研发提供了强有力的工具，而且可以应用到现代医疗体系中，服务于人民健康相关的预防、**和个性化治疗，以及食品与疫情检测等。
