国际部中美课程班(VIA)
“一校四区”建成后，全校的教学和办公条件将得到较大的改善，但学校的多校区管理将成为学校管理的新课题。学校综合兄弟学校的实践经历，精心研讨和反复论证，按照“一套领导班子，一套管理制度，统一调配人、财、物，各校区分类管理”的原则，制定学校管理的新办法，形成学校管理的新模式。
根据2010年白下区政府有关教育布局调整的决定，从2011年7月起，通过两年的建设和调整，南京三中将建成“ 一校两部四区”的校园布局，即 高中东校区(原六中校区)(高一高二)(白下路193号)、高中西校区白下校区(原三中本部)(高三)(白下路117号)、初中文昌校区(初一初二)(文昌巷63号)、初中金銮校区(初三)(新街口羊皮巷原67中 )。其中高中部东校区(原六中)主要为高中一、二年级办学点;西校区(原三中本部)为高三年级独立校区。
构建“一校两部四区”的学校管理模式
国家级示范高中、江苏省四星级南京市第三高级中学是一所蕴含着丰富的智力背景和深厚文化底蕴的百年名校。从老校长陶行知先生的先进教育思想到新世纪的特色办学之路，南京三中坚持着“学生学会做人，学会学习，学会创新”的办学理念，形成了淳朴友爱的校风、积极向上的学风和严谨求实的教风，一直得到社会各界和家长的充分肯定，这是学校稳定、持续发展的动力，也是学校不断进步和成功的归因。
学校有一支在岗敬业、爱生奉献、踏实努力的教师队伍。现有高级教师107名，特级教师、市、区学科带头人14人，市优秀青年14人。学校师资雄厚，教学严谨，校风纯正。有特级教师经志俊老师、曹国盛老师、金本钺老师;有南京市首届陶行知奖获得者、南京市名校长吕天纵老师;有南京市劳模宫为民老师;有全国先进教育工作者黄涵老师;有省先进教育工作者洪余义老师;中国好人提名、省好人胡新秀老师;有全国著名班主任陈宇老师……德才兼备的南京市第三高级中学教师团队，为培养具有求真精神的现代化人才孜孜以求着...
南京市第三高级中学(南京市第三中学、南京三中)坐落在秦淮区(原白下区)太平南路商业街，为江苏省四星级高中。校址原为创建于光绪二十八年。由南京三中、南京六中、南京市第六十七中学和南京市第二十二中学合并而来。
2014年4月，学校报请南京市教育局批准，正式开设中美课程班。与美国佛蒙特州国际学校(VermontInternationalAcademy(VIA))合作，成立美国佛蒙特州国际学校(VIA)南京市第三高级中学校区，全面引进美国VIA高中课程。为中国高中学生提供优质的国际教育，开启通往世界顶级大学的绿色通道。
