於民国96年（2007年）4月8日（佛诞节），举行「成立揭牌暨首任校长就职典礼」，成為我国第一所纳入高等教育体系的宗教研修学院，名為「法鼓佛教研修学院」依据教育部於民国96年（2008年）三月召开研订「宗教研修学院设立办法草案」会议决议：宗教研修学院及其系，所，学位学程，均应冠以该学院所属宗教惯用之名称，不硬性规定冠以「研修」之文字本校报请教育部自97学年度起（8月1日）核可，更名為「法鼓佛教学院」以过去已具备之「印度佛学组」，「中国佛学组」，「西藏佛学组」师资阵容，融合汉传，南传，与藏传佛教之精华，开创佛教研修之新纪元以培养佛学数位典藏与知识管理系统人才巴，藏之佛典语文的训练，及加强英，日语之学习，建立「佛典翻译学程」，以开展各种传统与创新相融的学科可融合法鼓山僧伽大学佛学院与僧团之朝暮课诵，禪坐或定期共修為平常定课，以养成修行习惯结合法鼓山国际佛教园区之教学资源，进行禪修，仪轨，弘化等各类行门的理论探讨与歷史演变之考察，以及实践修行指标之建立，借此学以致用的学习歷程，让学生们配合生涯规划，并养成自主终身学习的习惯，以酝酿研究与修行并重学风，以及学业与志业结合的发展「法鼓佛教学院」也可与筹设中的「法鼓人文社会学院」搭配，建构佛法与世学兼备的教学环境，让学生们可互相作跨校选择辅修学系与双主修学系，以培养具有科际整合能力之佛教研修人才，造就具有宗教情怀之社会服务人才。
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