此外亚太研究院还有两个建制独立的机构，即学位学科评议组和教师职务聘任委员会今后还可能建立新的相关机构，中大国际关系学系从政治与公共事务管理学院（政务学院）划入亚太研究院，而同时历史系的数名教授出任研究院负责人亚太研究院在学科上和政务学院，在行政上和历史系的关系非常密切是出于国家发展的需要和学科发展的需要是特别本科生教育；二是队伍建设，锻造区域和国别科研队伍；三是学科建设；四是开展科学研究亚太研究院主要有三大任务：一是对亚太地区的国际政治和国际关系开展科学研究；二是在亚太区域内进行国别研究；三是培养国际关系领域的专业人才分管学科建设和学院发展规划分管科研，外事和财务工作研究生培养和留学生工作院办和学生教育管理工作。
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办公室主任：吴利静
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行政人员：胡文涛
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