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本所设有办公室、受理与发证科、公共场所卫生监督科、职业卫生监督科、医疗消毒监督科、传染病防治监督科、学校卫生与饮用水卫生监督科、卫生案件稽查科共七科一室。贯彻执行国家卫生法律、法规和方针政策，佛山市南海区卫生监督所官网组织、协调、指导、监控、检查、督促和落实全区卫生监督执法工作。组织实施全区卫生监督工作规划和年度计划，制定相关卫生监督指引、要求；组织实施全区卫生监督专项整治、佛山市南海区卫生监督所▲专项检查和专项抽检计划；负责受理对违法行为的投诉、举报，负责全区卫生案件和上级交办卫生监督案件的调查处理；承担全区重大活动的相关卫生保障工作(除食品安全卫生以外)；负责全区突发公共卫生事件的调查处理；对全区卫生行政许可和卫生监督执法工作进行质量控制、督促检查和评估；开展执法稽查，对全区卫生监督机构和执法人员的执法风纪、行为进行督察；负责公共场所卫生许可,并对其卫生条件、卫生设施、经营活动及从业人员的健康管理进行卫生监督检查，查处违法行为；负责放射诊疗单位的放射诊疗许可和监督检查，查处违法行为；负责职业卫生监督执法工作，承担建设项目职业卫生审查、职业病危害事故处理、职业病危害申报审核、作业工人健康监护监管和作业场所卫生监督工作任务，佛山市南海区卫生监督所官网，查处违法行为；依法对医疗卫生机构进行监督检查，规范医疗服务行为，打击非法行医，查处违法行为；负责传染病防控的卫生监督工作，落实疾病预防控制措施，查处违反《传染病防治法》的行为；负责生活饮用水卫生监督工作，查处集中式供水单位的违法行为；开展学校卫生监督执法，指导、协调全区学校卫生工作，监督落实学生常见病防治措施，查处违法行为；实施消毒产品和涉水产品生产经营日常监督执法；协助省、市级卫生监督部门做好卫生许可和预防性卫生监督工作；负责全区卫生监督信息的汇总、核实、分析和上报工作；组织全区卫生监督业务的科研、培训，开展卫生法律法规宣传教育；承办区委、区政府和上级部门交办的其他事项。
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佛山市南海区卫生监督所是依照公务员管理的副局级单位，定编40人，负责全区卫生监督执法工作。现全区共设立8个镇(街道)卫生监督分所，监督人员160多人，负责辖区内规定范围的卫生监督执法工作。
