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南菁正在以新校区启用和加快实施十二五规划为契机，以 “文化引领、质量为本、特色建设、创新发展 ” 为发展战略，不断加快创建江苏省五星级学校的步伐，朝着建设国内一流、国际有影响现代中学的目标奋力前进。
近年来，学校全面推进新课程改革，江苏省南菁高级中学，http://www.njschool.cn，加大校本课程开发力度，引进欧美课程。 “红楼梦选读 ” “科学与实践 ”、 “探索自然科学的奥秘 ”、 “欧美文化 ”、 “加州课程 ”等50多门选修课和研究性学习课程让学生有充分的课程选择权，促进了学生的全面发展。
“自主为先 ”、 “学科培优 ”、 “审美熏陶 ”、 “智勇兼备 ”是南菁教育的鲜明特色， “让文化引领学校发展是学校的办学指导思想 ” ， “文化引领、质量为本、江苏省南菁高级中学品牌建设、全面提升 ” 是学校的发展战略。学校培养学生自主学习、自主管理和自主创新的能力，为学生的全面发展打下基础。每年有50人左右获国家奥赛一等奖，有100人左右通过重点大学的自主招生考试，有10人左右考取清华北大，50人左右考取欧美一流大学。南菁学生高祺凭借扎实的理论知识、开阔的思维能力和良好的综合素质，成为江苏享受清华降60分录取的第一人。
南菁的前身，是江苏学政黄体芳于光绪八年在兵部尚书、两江总督左由宗棠的赞助下创办的 “南菁书院 ”。清末，她是江苏全省的最高学府和教育中心。 “南菁 ”之名源自朱熹《子游祠堂记》“南方之学得其菁华 ”句，取南学 “约简 ”之特色，崇尚经世致用的实学，构建新的学风与新的学派，以达成 “南国菁英，于兹孕育 ”。
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