北京药师协会的领导机构是理事会和常务理事会，下设秘书处和3个专业委员会，5个工作委员会社会团体登记管理机关北京市民政局的业务指导和监督管理，是党和政府联系广大药师的桥梁和纽带，是推动北京药学科技事业发展的重要力量维权，协调，服务，主要开展以下方面业务：1，履行团体职责，加强药师的自律管理，规范药师执业行为，维护药师合法权益；2，学习，宣传药品监督管理的法律，法规，贯彻执行合理用药有关规章制度；3，开展与药师相关的培训服务及继续教育，加强药师队伍建设，提高药师的执业能力；4，组织开展与药师相关的药学方面的研究工作；5，接受政府主管部门委托，参与有关药师管理法规，规章的制定；承担有关药学学术发展，药品合理使用及监管等方面的任务和项目；6，组织开展国内外药学技术的学术交流与合作；7，介绍，推广药学新理论，新知识，新技术，新方法，促进药学技术的发展和进步；8，通过对药师队伍的现状，要求和愿望的调研，为政府制定药师队伍管理和医疗服务质量管理的政策，法律，法规提出建设性意见；9，依照有关规定编辑出版药师学术刊物和科普资料，宣传和咨询合理用药的知识，向药学人员及公众提供药学信息和健康知识服务；10，经政府有关部门批准，表彰，奖励在生产，经营，使用，教育，科研中为推动合理用药，保障公众健康做出突出贡献的与药师相关的人员医药企业，医疗机构联系密切，并与部分省级执业药师协会建立了合作关系已经实现了与执业药师学历教育的衔接专业培训和科普宣传活动，并积极承担北京市药品监督管理局，北京市卫生局委托的专项任务。
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