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随着对南京大屠杀事件的广泛宣传，该馆在国内外的影响日益扩大，很多国内外的游客都慕名前来参观和凭吊。他们普遍反映，波兰奥斯维辛集中营及日本广岛原爆纪念馆，均被列入世界文化保护遗产，而同样作为二战中世界三大惨案之一的侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆，也要按照世界文化保护遗产的要求来规划和发展。全国、侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆官方网站，http://www.nj1937.org，省、市政协委员也分别就加强该馆基本建设，在全国、江苏省和南京市政协会议上有过多次提案，均提出按世界文化保护遗产的规模来规划与建设。目前，该场馆扩建和申报世界文化遗产工作正在积极议定之中。
在队伍建设上，建立和形成了一批以国内外大专院校教授、社科院、档案馆、博物馆研究员为主体的专家学者队伍；建立和形成了一支南京大屠杀幸存者、见证者队伍；建立和培养了一支以专职讲解员为主体的、若干大得五项国家级荣誉中、侵华日军南京大屠杀遇难同胞纪念馆官方网站小学学生义务参与的讲解员队伍；建立和培养了一支乐于为基地建设努力奉献的员工队伍。
纪念馆新馆造型犹如一艘巨大的 “和平之舟 ”：东部拔地而起的高大船头是陈列丰富的展厅，周边庄严肃穆的广场可容纳万人集会；中部是原馆的遗址悼念区；西部大片开阔区域是树木葱茏的和平公园；另外，还有十多座形态逼真、寓意深刻的雕塑点缀其中，整个展馆分展览集会区、遗址悼念区、和平公园区和馆藏交流区等4个功能性区域，是一座纪念性的遗址型历史博物馆，也是全国爱国主义教育基地和全国文物保护单位。该馆先后获得 “中国八十年代十大优秀建筑设计奖 ”、 “中国九十年代环境艺术设计十佳 ”、 “被西班牙《趣味》月刊评为世界十大 “黑色旅游 ”景点 ”、新馆雕塑荣获 “2007年度中国最佳雕塑群 ”、 “建国60周年建筑优秀奖 ”、 “2007－2008年度全国博物馆十大陈列展览精品奖 ”、 “2009年度中国建设工程鲁班奖 ”等殊荣。
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