软件工程学院的学生修完培养方案规定的全部课程考试成绩和品德考核合格，并参加相关专业的认证考试，取得认证证书，将颁发教育部承认的福建农林大学毕业证书，并可根据福建省当年的有关政策选择参加专升本考试。福建农林大学软件工程学院与福建农林大学海外学院合作，举办出国留学预备班，使有志出国留学的学生，能出国深造。
软件工程学院重视学生基础能力和职业能力培养，建立了完善的学历教育体系，建立了加强软件开发实战训练的校内外实训基地，实施了以职业能力为核心的“学历+认证+实训”应用型人才培养模式。创办以来就与全美测评软件系统有限公司(ATA)合作，开展ATA认证考试。学生在校期间参加ATA认证考试，通过者可获得相关的专业认证证书，目前在校学生认证考试一次通过率平均达到90%以上。2008年第一批获得美国微软公司授牌为“微软IT合作院校”。2008、2009、2010年连续3年专升本升学率均位居全省同类院校第一位。2008年微软全国“校园之星”大赛及2008年福建省教育厅第二届高职技能大赛名次及获奖数居全省同类院校第一位。2009第三届微软IT院校“校园之星”大赛获得福建赛区软件方向第一名，全国总决赛第三名的成绩。
软件工程学院师资以福建农林大学校本部教师为依托，与省内著名IT企业共建，目前已拥有一支爱岗敬业、学有专长、结构合理的专业教师队伍。担任专业基础课和专业课教师的专任教师均来自IT企业，有丰富的实践经验。
福建农林大学软件工程学院，位于福州市金山，福建农林大学本部内，拥有近万平方米的独栋教学楼、实验室、2300平方米标准的实训车间和20兆光纤直连城域校区网，并享用福建农林大学校本部丰富图书资源、本部礼堂、风雨操场、400米跑道标准田径运动场和活动场所，体育设施齐备。
福建农林大学软件工程学院(原福建农林大学软件高职人才培养基地)是经福建省教育厅批准设立，为福建农林大学二级学院(福建农林大学唯一专科学院)。自办学以来秉承“明德、诚智、博学、创新”的校训精神，立足福建省经济发展实际，努力培养高素质、竞争力强、应用技能型IT人才。
