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辖3个镇3个苏木，1个农牧业示范园区，6个社区居委会，13个嘎查，总面积11.46万平方公里，总人口2.6万多人。
2006年，额旗将原有的8个苏木镇调整为5个苏木镇，撤销合并苏木镇3个。其中将温图高勒苏木并入达来呼布镇；撤销古日乃苏木和巴彦宝格德苏木并入新建的东风镇。额济纳旗政府网，http://www.ejnq.gov.cn，此外，原苏泊淖尔苏木、赛汉桃来苏木、马鬃山苏木保留，行政区域不变。
额济纳旗是一个以蒙古族为主体多民族聚居的边境旗。有土尔扈特、阿拉善和硕特、哈拉哈蒙古三个部落，少数的布里亚特蒙古族，总人口16874人。其中男性8602人，女性8272人。非农牧业人口11286人。额济纳旗政府网有蒙古、汉、回、满、藏、土家等10个民族。少数民族人口5188人，其中蒙古族4891人、回族190人、满族55人、藏族8人、土族16人，其他民族28人。
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