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根据南京市规划局规划要点及南京市第二医院五年发展规划，我院正在建设一座医技病房大楼，地下一层，地面20层，建筑面积3.8万平方米，预计建成后，南京市第二医院的放射、影像、病理、腔镜、实验室、南京市第二医院官网消毒供应室、中心配液室的建设将跨上一个新的台阶，医疗服务范围和服务能力将大大加强。我们有信心把医院建成政府和人民满意、放心的研究创新型、资源节约型和人文和谐型医院，以一流的技术、一流的人才、一流的环境、南京市第二医院▲一流的服务奉献于社会、奉献于病人，为保障人民健康做出新的贡献。
医院十分重视环境的美化、绿化工作，门诊及病房周围建立了绿化带，院内各种花卉争奇斗艳，环境优美，为名副其实的花园式医院。2007年投入使用的3.3万平方米新门诊病房大楼配有各种现代化医疗、抢救设施，可满足不同层次患者的需要，为病人提供舒适温馨的就医场所。
医院作为东南大学医学院附属医院、南京大学医学院、南京医科大学、南京市第二医院官网，南京中医药大学、南通大学教学医院、东南大学医学院硕士研究生培养点及省级医学继续教育基地之一，其科研水平得到公认。近六年获科研成果38项，其中部级奖2项，省科技进步奖4项，省卫生厅新技术引进一等奖4项，二等奖10项，南京市政府科技进步奖14项，其中一等奖3项，二等奖1项，三等奖10项。已完成省部级科研项目10项，目前正承担的国际合作项目1项，国家重点专项1项，省部级项目10项，编写专著7部，获专利证书1项。发表SCI论文25篇，中华系列期刊论文50余篇。南京市第二医院▲，医院每年承担东南大学本科5个班，研究生2个班，南京大学研究生1个班，南京中医药大学留学生4个班的教学任务，已独立培养毕业研究生12人。
医院设有肝病内科、外科、妇产科、儿科、感染病科、中西医结合科、门急诊、ICU、人工肝治疗中心、南京市第二医院官网血液净化及肾脏科、肿瘤科、消化科、老年病科、骨科、皮肤性病科、放射科、放疗科、肝病检测中心、体检中心等临床医技科室。门诊设有相应的专科及专家特色门诊，同时开设心血管科、呼吸科、神经内科、免疫科、内分泌科、南京市第二医院▲血液科等内科门诊。医院有3个省级诊疗技术中心，省市重点学科、专科6个。2009年5月我院被确定为第一批江苏省综合（专科）医院示范中医科建设单位。2010年2月4日，国家中医药管理局发布通知，我院成为江苏省唯一被国家中医药管理局确定的中医药防治传染病重点研究室建设单位。
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南京市第二医院，又名东南大学附属第二医院，由宋美龄基金会创建于1933年，有77年历史。南京市肿瘤医院、南京市老年病医院与我院合署，南京市肿瘤防治办公室也设在我院。医院专业设施完善，技术力量雄厚，医疗设备先进，是集医疗、教学、科研为一体的江苏省三级甲等医院。现任院长赵伟博士是江苏省医学领军人才，江苏省传染病学科带头人，卫生部表彰的全国卫生系统先进个人，享受国务院政府特殊津贴。
