医院设保健部、门诊部和临床部：保健部设保健门诊22个，设有群体保健、项目管理、妇女保健、儿童保健、围产保健、出生医学证明管理、妇幼信息管理、健康教育等保健业务科室；临床部分三大块：住院部、门诊部、桂林市妇女儿童医院官网急诊部。住院部设妇科、产科、儿科、新生儿科、小儿神经康复科；普外科（小儿心胸外科）、骨外科、颅脑外科、泌尿外科、桂林市妇女儿童医院▲五官科；心血管、神经、消化、内分泌、呼吸内科、肾内科、肿瘤科。急诊部为全市120分站，承担着全市危重孕产妇和儿童抢救任务。医院拥有双排螺旋CT机、C型臂数字血管减影机、乳腺钼钯机、直接数字成像（DR、CR）、桂林市妇女儿童医院官网，数字胃肠造影等先进设备和技术。
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桂林市妇女儿童医院经桂林市人民政府批准，于2006年2月由桂林市妇幼保健院和原桂林市第四人民医院整合而成。桂林市妇幼保健院其前身为英国基督教会道生医院，始建于1911年6月，已有近百年的历史，为桂林市首家西医医院，广西壮族自治区最早建立的妇幼保健院，1998年通过 “二级甲等 ”妇幼保健院评审，同年底地市合并，原地区妇幼保健院并入桂林市妇幼保健院。原桂林市第四人民医院其前身为桂林市地区人民医院，1951年创建，2000年增挂 “桂林市红十字会博爱医院 ”牌子，2001年通过 “三级乙等 ”医院评审。 作为桂林市医疗卫生系统改革与卫生资源整合的新型 mdash; mdash;桂林市妇女儿童医院，在历代妇幼人的奋发努力下开拓创新、阔步前进、实现跨越式发展。历经风雨的百年老院规模不断扩大，业务迅速发展，现已成为集保健、医疗、教学、科研为一体，以妇幼品牌为主导、以综合实力为后盾的三级综合性医院，2009年9月该院顺利通过自治区三级甲等妇幼保健院等级质量管理现场评审。
