普通外科：开展胸腔镜、腹腔镜下手术颇具特色，在市内率先开展了对各种良、恶性肿瘤的选择性腔镜治疗。在消化道肿瘤的根治手术、早期乳癌手术等积累了丰富的临床经验。开展了：负填式无张力疝修补在老年复发疝的应用；晚期食道癌食道狭管带膜支架置入术；各种腔镜手术。
心血管内科：在冠心病、心梗塞的诊治方面较早开展了冠心病的介入诊断、治疗，诊治病例数载本市前茅。在高血压、桂林市第二人民医院官网冠心病诊治及科研方面处在市内领先地位，在高血压系列科研方面尤为突出，先后获多项省级、市级科研技术成果奖。开展了：经皮冠状动脉成形术；冠状动脉内支架置入术；经挠动脉穿刺行冠脉介入治疗；左右心室检查造影术、埋藏式永久起搏器装置术、临时起搏器安术；先心介入治疗等。设有彩色中央监护系统、24小时动态心电检测、桂林市第二人民医院▲活动平板检测。
内分泌科：是桂林市糖尿病医疗教育中心，在桂林市有着广泛良好的影响，对救治糖尿病各种急慢性并发症方面有丰富的临床经验。开展了：1.糖尿病及各种急慢性并发症的诊断治疗；2.甲亢、甲状腺肿、甲状腺瘤、甲亢性心脏病及并发症治疗；3.风湿免疫类疾病如红斑狼疮、硬皮病、干综合征类风湿关节炎诊断治疗；4.中老年骨质疏松、更年期综合症等疾病的治疗。
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桂林市第二人民医院是一所集医疗、预防、保健、教学、科研等功能于一体的三级甲等综合性医院，始建于1916年，拥有副主任、副教授以上职称65人，中级职称284人，在职研究生11人，以心血管内科、消化内科、内分泌内科、呼吸内科、普外科、骨科、眼科、新生儿科、麻醉科、物理诊断科、放射科为优势科室，是全市医院中唯一取得职业健康体检与职业病诊断资格医院。
