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研究院设立基层党委1个，下设党支部16个（其中，离退休党支部3个），有农工、九三、民盟和民革等4个民主党派。
建院以来开发了极具影响力的技术和产品，如大孔树脂分离技术，天府可乐饮料，地奥心血康、肝康宁、白血宁、重庆市中药研究院官网火把花根 片、还少丹、复脉定等药品；中药标本的馆藏量及中药资源学至今领先全国，服务能力最强和效果最佳。
全院现有在职职工235人（离退休职工217人），其中科技人员占职工总数的65.7%，科技人员35岁以下111人；具有研究生以 上学历43人；高级职称40人（其中正高18人），中级职称65人；享受国家政府津贴专家3人；省级学术技术带头人5人，后备 学术技术带头人1人；国家药典委员会委员2名；先后聘请3名院士、10余名全国知名专家为客座研究人员。
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重庆市中药研究院，其前身为国民党工商部1930年7月在南京创建的中央工业试验所。经历解放前后以及川渝分家等历史的变 迁，现为重庆市委科技工委、重庆市科委直属副厅局级事业单位，是目前国内“历史最悠久、占地面积最广、学科配套最齐 全、中药标本收藏量最大”的中药科研单位。自2009年起，经重庆市编委批准，加挂有“重庆市中药博物馆”牌子。
