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特色专科：医院秉承 “继承不离古，发扬不离宗 ”的发展理念，努力挖掘和建设中西医结合特色专科，建有中西医结合重点专科8个，其中中西医结合骨伤科为国家中医药管理局规划建设重点学科，重症医学科为 “十二五 ”国家重点培育项目；骨伤康复科、神经专科为省级重点专科；肿瘤专科、心内科、消化内科、厦门大学附属福州第二医院，http://www.fzsdeyy.com，神经内科为市级中西医结合重点专科。 “十一五 ”国家重点建设骨伤科顺利接受国家专家组的评审，目前我院骨伤科已成为海峡西岸规模最大的专业骨科。8个重点专科床位数达905张，重点专科床位数占全院床位数的69.3%，其中中西医结合骨科病区数占全院床位数的38.5%，占重点专科床位数的60.8%，为全省三级综合性医院接诊治疗创伤病人最多、规模最大的骨科医院。环形支架治疗僵硬性马蹄内翻足，弹性髓内钉治疗儿童长骨干骨折关节镜技术和运动损伤等治疗技术达到国内较高水平。
发展规模：医院占地面积26146平方米，建筑面积80335平方米。医院设有31个临床科室，厦门大学附属福州第二医院11个医技科室，现有编制床位数1300张。医院以骨伤科为龙头，集医疗、科研、教学、预防、康复为一体的中西医结合医院，为厦门大学附属医院，福建医科大学、泉州医学高等专科学校、福建卫生职业技术学院教学医院，福建中医药大学骨伤博士、硕士研究生及中西医结合临床医学硕士研究生培养基地。全院共有65人担任全国和省级各学术团体委员、常委、副主任、主任委员职务。
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