现已发展成为年出书400余种的中等规模的综合性科技出版社。设农业技术、医药卫生、工业技术、第一综合、第二综合(建筑)、研发中心六个编辑室，出版农业技术、中西医药、电子电工、建筑装饰、生活保健、综合科普等门类 的应用技术读物、工具书、专业参考书、学术专著及科普知识读物。建社三十年来，已出版各类图书近3000种，并在建筑装饰、中医中药、宠物园艺等门类上形成了特色，先后有300余种图书在国家级、省（部）级图书评奖中获奖。2000年被国家新闻出版总署评为全国良好出版社。
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立足福建，面向全国，发展对外，是福建科学技术出版社长期坚持的工作方针；面向市场，贴近读者；质量至上，内容为王；以人为本，诚信第一是福建科学技术出版社始终奉行的办社原则。
