《扬子晚报》在总编辑主持的编辑委员会领导下开展工作。报社设有总编办公室、考评办公室、流程督察办公室、时政部、财经部、教卫部、南京采访部、热线新闻部、区域新闻部、国内部、国际部、专副刊部、要闻编辑部、文化部、体育部、网络新闻部、信息部、广告出版部、视觉部、版面部、校对部、发行部、广告经营中心等。
《 扬子晚报》积极创建新媒体，1998年开通扬子晚报网，2001年被国务院新闻办批准为江苏首家新闻网站，每日点击率达到500万PV；2002年创建了华东地区首家新闻媒体的呼叫中心，同时，陆续开通手机短信、手机报、WAP站点、视频直播报网互动等业务，是中国最早涉足全媒体的新闻单位，其中手机报收费用户2009年底已经超过200万。
二十多年来，《扬子晚报》版面由最初的4开4版增至4开16版、20版、48版、64版，南京地区最多时超过200版,其中的宝贝周刊、声色周刊、成长周刊、生命周刊、电视周刊、环球博览、主妇时代、风尚特刊、商界大观、教育资讯、扬子楼市以及家居、美食、旅游、数码等专刊、周刊也深受读者喜爱，创刊以来，发行区域不断扩大，目前已密集覆盖南京和江苏地区，日发行量保持在180万份左右，是中国发行量最大的晚报都市报。广告营业额已跻身全国报界前6名，2009年利税总额2亿多。
《扬子晚报》在江苏各地及北京、上海设有记者站，在江苏各省辖市和周边地区的上海、安徽等地共设有17个分印点，每天凌晨同步传版印刷，清晨上市。
扬子晚报四个字为时任中共中央总书记胡耀邦同志亲笔题写。二十多年来，《扬子晚报》遵循宣传政策、反映生活、倡导文明、传播知识的办报宗旨，以提升公信力、引导力和影响力，办一张党和人民都满意的报纸为己任，逐步形成了导向正确、信息密集、热点集中、服务到位、可读耐读等特色和优势。
