学校于1955年开始招收研究生,1981年经国务院学位委员会批准首批具有博士,硕士学位授予权,2000年经教育部批准试办全国林业院校中唯一的研究生院学校共授予硕士,博士学位1500余人学校专门设立了优秀博士论文工程,研究生创新实验中心,研究生培养基金,研究生教改立项和教学用书建设基金,研究生学术交流基金等德国,澳大利亚,丹麦,日本,韩国,新加坡等多个国家合作培养研究生取得实质性进展28个二级学科博士点,50个硕士点和2个硕士专业学位点(工程硕士和农业推广硕士);建有林学,生物学2个博士后流动站5个部级和市级重点学科,5个部级重点开放实验室和1个国家理科基地硕士点覆盖农学,工学,理学,文学,管理学,经济学,哲学,法学8个学科门类和27个一级学科。