收集、整理、研究我市的各种信息资料，为各级教育领导决策和教育科研人员提供咨询。
指导我市教育系统的教科研工作，负责指导各区县教科室的科研工作，推动基层教育科研工作的开展。
负责市级课题的规划、过程、成果管理，促进优秀成果的产生。组织国家和省级课题的申报、规划立项课题的管理。
根据市教育局意见，对我市教育和教学改革的重大课题，组织研究队伍，开展专题研究。
在南京市教育领导下，接受中央教科所和江苏省教科院业务指导，负责南京市教育科学研究与管理工作。
坚持为领导决策服务、为教师教育教学服务、为提高教育教学质量服务，为提高办学整体效益服务的基本方针。积极开展优秀科研成果的推广工作，发挥教科研兴教的作用。
南京市教育科学研究所成立于1984年6月，是南京市教育系统进行教育科学研究的专门机构，隶属于南京市教育局。它的主要任务是：以马克思列宁主义、毛泽东思想、邓小平理论、三个代表的重要思想为指导，以先进的教育科学理论为基础，组织和开展南京市教育事业发展中有关理论和实践的科学研究，为教育行政宏观决策服务，为教育教学改革实践服务，为繁荣教育科学事业服务。
加强市、区县教育科研机构建设，加强教育科研的队伍建设。有计划地在学校领导、教师中普及教育科学理论和教育科学研究知识，建设一支有质量和数量的教育科学骨干队伍。
