2005年3月15日，中国气象局正式批准成立淮河流域气象中心。5月18日，中国气象局许小锋副局长和安徽省政府赵树丛副省长为淮河流域中心揭牌，并召开了流域中心协调委员会第一次会议。2005年6月1日，淮河流域中心投入业务试运行。
中国气象局领导对此高度重视，秦大河局长、郑国光副局长、刘英金副局长、许小峰副局长、淮河流域气象中心官网王守荣副局长、宇如聪副局长先后到蚌埠进行实地视察或听取了淮河流域气象中心建设的汇报。
淮河流域省级气象业务实行分工协作：安徽省气象台承担淮河流域中短期天气预报、气候**业务，向淮河流域气象中心提供流域性预报产品；流域内各省气象台向淮河流域气象中心实时传输本省实况资料；流域内各雷达站向淮河流域气象中心实时传输雷达监测产品以及定量估测降水资料；淮河流域气象中心制作全流域临近预报，为淮委和各级气象台站提供预警服务。
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淮河流域气象中心经中国气象局批准设立，行使流域气象信息汇集和服务两大职能。流域气象中心为安徽省气象局直属事业单位，为了便于与淮委联系工作和提供服务，该中心设在蚌埠市。中心内设办公室、综合信息室和预报服务室。
