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2004年4月顺利通过了 “中国实验室国家认可 ”，获得认可的技术能力遍及化学、生物、声学及振动、燃料、光学与辐射等5个领域共195个项目，成为福建省环境保护系统首个通过认可的单位。
二十多年的监测科研实践，大大提高了我站的监测技术能力，建立了一套完整的质量管理体系。厦门市环境监测中心站，http://www.xmems.org.cn，在历次中国环境监测总站，海洋网的各项考核中，我站均获得优异的成绩。多次获得上级有关部门的表彰，曾荣获省环境监测优秀站、省环境监测优质实验室、国家环境监测优质实验室、全国环保系统先进监测站等称号。1995年还荣获国家劳动人事部、国家环保局授予的全国环境保护系统先进集体。
厦门市环境监测中心站的主要职能是对全市环境质量包括水和废水、降水、海水、空气、厦门市环境监测中心站废气、土壤、沉积物、生物群、固体废物、机动车尾气、声学及振动、燃料、光学与辐射等环境要素进行监测；定期向同级环境保护主管部门和上级监测站呈报本市环境质量现状；为污染源的监督管理与执法提供监测数据；开展社会服务性监测；建立辖区内应急监测网，为辖区内污染事故处理和污染纠纷仲裁提供监测数据；开展环境监测科研工作，进行环境测试新技术、新方法的研究，参加地方标准的制定和其他环境科学研究。
教育，政府组织，地方政府网站，厦门市环境监测中心站官网：http://www.xmems.org.cn
